Il pavimento della Basilica è in marmo e si estende per ben 2099 metri quadrati. La sua struttura marmorea è formata di due diversi intarsi di marmi: l'opus sectile (ottenuto dall'accostamento dei pezzi di marmo di vari colori che formano le geometrie più varie) e l'opus tessellatum (ottenuto da piccolissimi pezzetti di marmi o di vetri in grado di dar vita a figure floreali o animalistiche). Ambedue le tecniche hanno origini tanto antiche da venir documentate negli scritti di Varrone, Vitruio e Plinio.